Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms