Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED9Q6R2W3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms