Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms