Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms