Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A1Q6PCB7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms