Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT80Q6KB66 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms