Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIF1Q5UIP0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIF1Q5UIP0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RIF1Q5UIP0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RIF1Q5UIP0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms