Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms