Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms