Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIVEP3Q5T1R4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HIVEP3Q5T1R4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIVEP3Q5T1R4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIVEP3Q5T1R4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIVEP3Q5T1R4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIVEP3Q5T1R4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIVEP3Q5T1R4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIVEP3Q5T1R4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIVEP3Q5T1R4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms