Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf220Q5T0J3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms