Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAPCD1Q5SSQ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms