Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms