Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMPD3Q5JV73 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms