Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP78Q5JTW2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms