Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR4Q5GH76 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR4Q5GH76 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms