Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms