Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC178Q5BJE1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms