Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms