Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms