Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms