Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC39A12Q504Y0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A12Q504Y0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms