Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms