Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KHDC1Q4VXA5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC1Q4VXA5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms