Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms