Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LONRF2Q1L5Z9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF2Q1L5Z9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms