Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATP6V1FQ16864 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms