Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA3Q16787 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
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