Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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