Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITSN1Q15811 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITSN1Q15811 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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