Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP11Q15643 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms