Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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