Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRRQ15256 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRRQ15256 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRRQ15256 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRRQ15256 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRRQ15256 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRRQ15256 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRRQ15256 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRRQ15256 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRRQ15256 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRRQ15256 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRRQ15256 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRRQ15256 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRRQ15256 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRRQ15256 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRRQ15256 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPRRQ15256 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPRRQ15256 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRRQ15256 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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