Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPNMBQ14956 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
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