Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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