Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB1Q14028 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB1Q14028 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
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