Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC3Q14003 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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