Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PDE6HQ13956 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6HQ13956 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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