Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CBFBQ13951 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBFBQ13951 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms