Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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