Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3BPQ13352 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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