Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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SGCGQ13326 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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