Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX10Q13206 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX10Q13206 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms