Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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