Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK2Q13002 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK2Q13002 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK2Q13002 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK2Q13002 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK2Q13002 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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