Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms