Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TP53BP1Q12888 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TP53BP1Q12888 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms