Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXO1Q12778 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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FOXO1Q12778 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXO1Q12778 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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