Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.66□□□□□ -1.82
RTP1Q12751 CCE1YKL011C 1062 nt3.66□□□□□ -1.82
RTP1Q12751 OST6YML019W 999 nt3.66□□□□□ -1.82
RTP1Q12751 SHH3YMR118C 591 nt3.66□□□□□ -1.82
RTP1Q12751 SSN8YNL025C 972 nt3.66□□□□□ -1.82
RTP1Q12751 SQS1YNL224C 2304 nt3.66□□□□□ -1.82
RTP1Q12751 IOC3YFR013W 2364 nt3.65□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 DTD1YDL219W 453 nt3.65□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YIR040CYIR040C 333 nt3.65□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 TEM1YML064C 738 nt3.65□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.65□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 PFY1YOR122C 381 nt3.65□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YCG1YDR325W 3108 nt3.65□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 RTT109YLL002W 1311 nt3.65□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 RRP5YMR229C 5190 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MRH1YDR033W 963 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 AI3Q0060 1248 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YEL010WYEL010W 351 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YGR111WYGR111W 1203 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 NNF1YJR112W 606 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YLR012CYLR012C 300 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 COA4YLR218C 453 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 TRI1YMR233W 681 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 TIR2YOR010C 756 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 SRL1YOR247W 633 nt3.64□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MPS1YDL028C 2295 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 TPO5YKL174C 1857 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 PET54YGR222W 882 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YHL026CYHL026C 948 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 RPF2YKR081C 1035 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 SPP382YLR424W 2127 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 DLT1YMR126C 1029 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MCA1YOR197W 1299 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 snR42snR42 351 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 DPB3YBR278W 606 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 GYL1YMR192W 2163 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 EMP70YLR083C 2004 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 ART10YLR392C 1557 nt3.63□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 VPS3YDR495C 3036 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MFA1YDR461W 111 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YDR491CYDR491C 492 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YGL117WYGL117W 798 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YLL037WYLL037W 381 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 RAD33YML011C 534 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 DIA1YMR316W 1011 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 SMC3YJL074C 3693 nt3.62□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 URA2YJL130C 6645 nt3.61□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 snR68snR68 136 nt3.61□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 DPP1YDR284C 870 nt3.61□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 FSH1YHR049W 732 nt3.61□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YNL109WYNL109W 546 nt3.61□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 DCP1YOL149W 696 nt3.61□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 TYE7YOR344C 876 nt3.61□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 PRP22YER013W 3438 nt3.61□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 UBP8YMR223W 1416 nt3.61□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MDM10YAL010C 1482 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MUS81YDR386W 1899 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 PKH1YDR490C 2301 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YPS6YIR039C 1614 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 FAP7YDL166C 594 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YFL065CYFL065C 309 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 CUP1-1YHR053C 186 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 CUP1-2YHR055C 186 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 RPA12YJR063W 378 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YKL131WYKL131W 522 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 RPC37YKR025W 849 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MRPL16YBL038W 699 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 RIM11YMR139W 1113 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YMR141CYMR141C 309 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 TSR4YOL022C 1227 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 PEX34YCL056C 435 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 SRP68YPL243W 1800 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MDN1YLR106C 14733 nt3.6□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MNT3YIL014W 1893 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 PIB1YDR313C 861 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 RTT105YER104W 627 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 NEJ1YLR265C 1029 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 UBC12YLR306W 567 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 ERV41YML067C 1059 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 MRPL17YNL252C 846 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 YNL319WYNL319W 441 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 SAS5YOR213C 747 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 LTP1YPR073C 486 nt3.59□□□□□ -1.83
RTP1Q12751 CDH1YGL003C 1701 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 CHS3YBR023C 3498 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 MTR4YJL050W 3222 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 RPL15AYLR029C 615 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 ENV10YLR065C 546 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YBL062WYBL062W 381 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YOL114CYOL114C 609 nt3.58□□□□□ -1.84
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