Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 SMC2YFR031C 3513 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 MRH4YGL064C 1686 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 UPF3YGR072W 1164 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 RRM3YHR031C 2172 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 MMF1YIL051C 438 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 RRP14YKL082C 1305 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 MRPL38YKL170W 417 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 EAP1YKL204W 1899 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 STE23YLR389C 3084 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 SUB1YMR039C 879 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 SRL1YOR247W 633 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 DPB3YBR278W 606 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 TSC11YER093C 4293 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 SOK1YDR006C 2706 nt2.55□□□□□ -2
SME1Q12330 CWH41YGL027C 2502 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 CEP3YMR168C 1827 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 SRP68YPL243W 1800 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 ERG11YHR007C 1593 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 AI3Q0060 1248 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 PEX14YGL153W 1026 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 MET14YKL001C 609 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 RSF1YMR030W 1131 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 RPA43YOR340C 981 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 LTP1YPR073C 486 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 CDC5YMR001C 2118 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 SKO1YNL167C 1944 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 YNR063WYNR063W 1824 nt2.54□□□□□ -2
SME1Q12330 MRS2YOR334W 1413 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 DYN2YDR424C 279 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 SPT15YER148W 723 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 TDA10YGR205W 873 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 DAL2YIR029W 1032 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 SDH3YKL141W 597 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 NDL1YLR254C 570 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 YOL118CYOL118C 309 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 MCA1YOR197W 1299 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 SWD3YBR175W 948 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 ERV15YBR210W 429 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 ESL1YIL151C 3357 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 DBP7YKR024C 2229 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 ATG13YPR185W 2217 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 YCK2YNL154C 1641 nt2.53□□□□□ -2
SME1Q12330 CHO2YGR157W 2610 nt2.53□□□□□ -2.01
SME1Q12330 MET10YFR030W 3108 nt2.53□□□□□ -2.01
SME1Q12330 ARP9YMR033W 1404 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 AVT5YBL089W 1380 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YKL100CYKL100C 1764 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 TFC4YGR047C 3078 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 MRPL9YGR220C 810 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 LSM8YJR022W 330 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 DAD2YKR083C 402 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 INP1YMR204C 1263 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YNL043CYNL043C 321 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 ATG34YOL083W 1239 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YOL114CYOL114C 609 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YOR387CYOR387C 621 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 PBP2YBR233W 1242 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 GPI13YLL031C 3054 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YCL019WYCL019W 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 AI2Q0055 2565 nt2.52□□□□□ -2.01
SME1Q12330 INP52YNL106C 3552 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 DRS2YAL026C 4068 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 PPE1YHR075C 1203 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 IMP1YMR150C 573 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 RPL20AYMR242C 519 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 SSU72YNL222W 621 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 GRX7YBR014C 612 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 NIP7YPL211W 546 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 GWT1YJL091C 1473 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 ROM1YGR070W 3468 nt2.51□□□□□ -2.01
SME1Q12330 RAX2YLR084C 3663 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 CCT7YJL111W 1653 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 SLY41YOR307C 1362 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 UTP6YDR449C 1323 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 KRE2YDR483W 1329 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 DSE4YNR067C 3354 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 CPR1YDR155C 489 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 VMA6YLR447C 1038 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 THI80YOR143C 960 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 ICS2YBR157C 768 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 VHR2YER064C 1518 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 SHQ1YIL104C 1524 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 RSN1YMR266W 2862 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 MSH4YFL003C 2637 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 FRE2YKL220C 2136 nt2.5□□□□□ -2.01
SME1Q12330 YNL011CYNL011C 1335 nt2.49□□□□□ -2.01
SME1Q12330 POL4YCR014C 1749 nt2.49□□□□□ -2.01
SME1Q12330 STE6YKL209C 3873 nt2.49□□□□□ -2.01
SME1Q12330 COP1YDL145C 3606 nt2.49□□□□□ -2.01
SME1Q12330 ERP3YDL018C 678 nt2.49□□□□□ -2.01
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